Хуана Інес де Асбахе-і-Рамірес народилася 12 листопада 1651 неподалік від Мехіко, в селі Сан-Мігель-де-Непантла. Її батьки, як припускають, не були повінчані, і тому Хуана і дві її старші сестри записані в парафіяльних книгах як «діти Церкви», тобто байстрюки.
До 6 років вона навчилася писати, шити й вишивати, що в ті часи становило повну освіту жінки. До восьми років Хуана прочитала всю бібліотеку діда, включаючи праці з філософії, богослов'я та медицині.
У 9 років вона розлучилася з сім'єю: мати відправила її в Мехіко до дядька і тітки, багатим родичам, вхожим у палац віце-короля. Завдяки щасливому випадку вони розгледіли в дівчинці здібності, надавши Хуані можливість вчитися. Новий курс самоосвіти включав літературу, природничі науки, математику, філософію, теологію та іноземні мови. До всього цього Хуана виросла красунею: світло-карі широко поставлені очі, високе чоло, прямий ніс, витончені руки, чарівна усмішка, живий і товариський характер — все це не могло не привертати до неї людей.
У 1664 році Хуана була представлена ??при новому дворі і в найкоротший час завоювала таку любов високої чети, що віце-королева зробила її своєю першою фрейліною. Цю посаду вона займала близько 5 років. Тоді ж вона прославилася написанням віршів на іспанською, мовою ацтеків, а також на латині. Писала вона і для спектаклів, і для нічних концертів, і для церковних свят, і для похорону.
Були у Хуани і недоброзичливці. Одного разу хтось пустив чутку, що її знання поверхові, і вона вміє лише вселяти, що володіє ними. Для спростування подібних наклеп віце-король прийняв рішення організувати публічний іспит, на якому Хуані задавали питання з усіх галузей знань. Але вона блискуче справилася з самими каверзними завданнями.
Що стосується особистого життя, то шанувальників у Хуани було безліч, і практично всі вони були серйозними претендентами на її руку і серце. Але Хуана відмовляла всім претендентам її руки.
У серпні 1667 року Хуана зробила першу спробу піти у монастир. Але незадовго до цього реформований статут обителі Святого Йосипа ордену босоногих кармеліток виявився занадто суворим для світської панночки. Вона серйозно захворіла і за наполяганням лікарів покинула обитель через три місяці. Тим не менше в лютого 1669 року Хуана вступила в монастир ордена Святого Ієроніма і після короткого послушничества прийняла постриг під іменем Хуани Інес де ла Крус.
У 1690 році Хуана написала спростування на проповідь, складену ченцем-єзуїтом Антоніо Віейра. Абсолютно несподівано її приватний лист було видано. Публікація мала великий успіх, проте церковне начальство в Мексиці звинуватило її в гордині і нехтуванні чернечої заповіддю слухняності.
Щоб відновити своє добре ім'я, сестра Хуана пише і публікує останнє і, мабуть, найвідоміший твір — «Відповідь сестрі Філоте», де на прикладі свого життя намагалася показати, наскільки необхідні можуть бути для жінки пізнання і творчість.
Але її духовні керівники наполягли на прийнятті сестрою Хуаном обітниці бідності. Разом з обітницею бідності вона дала обітницю не торкатися до перу і папері. Мехіко прийшов у таке хвилювання від її релігійного завзяття, що черговий архієпископ, слідуючи її Приміром, теж продав всі книги, а також коштовності, антикваріат і навіть власне ліжко ...
У 1695 році в монастирі почалася епідемія чуми, і, доглядаючи за сестрами, вона заразилася сама. 17 квітня того ж року Хуани Інес де ла Крус не стало. Зберігаючи вірність даному обітниці, вона написала заповіт на стіні келії пальцем, облитим власною кров'ю: «Тут будуть відзначені день, місяць і рік моєї смерті. В ім'я любові Господа і Його Пречистої Матері я молю своїх коханих сестер — і двох нині живих, і вже пішли — пом'янути мене перед Ним, хоча я була гіршою жінкою на світі. Підписано: я, Хуана Інес де ла Крус».