Особливість географічного положення Білорусі, яка полягає у відсутності виходу до моря , а також кордони з п'ятьма країнами здавна сприяли розвитку і зміцненню в країні митних правил та норм.
Закономірно, що в 1996 році, незабаром після проголошення Білоруссю незалежності, в Республіці був заснований професійне свято митників. День митника відзначається в країні щорічно 20 вересня.
20 вересня 1991 згідно з Постановою Верховної Ради Республіки Білорусь «Про митну службу Республіки Білорусь» Білоруське управління Державного митного контролю СРСР було перетворено в Державний митний комітет Республіки Білорусь.
Як заявив на прес-конференції в Національному прес-центрі Голова Державного митного комітету Республіки Білорусь А. Шпилевський: «... Встановивши в 1996 році це свято, держава підкреслило значущість професії митника і внесок митної служби у соціально-економічний розвиток країни».
З цього моменту розпочався новий етап у розвитку білоруської митної служби, який характеризується становленням її як правоохоронного органу, який стоїть на захисті економічних інтересів країни .
За час існування нової структури були розроблені і прийняті важливі документи, що створюють законодавчу основу роботи митної служби. У 1992 році був прийнятий Закон Республіки Білорусь «Про основи організації митної служби Республіки Білорусь», в якому були визначені правові та організаційні аспекти митної справи в Республіці, а також основні завдання митної служби.
Прапор митних органів Республіки БеларусьДалее, в 1993 році був введений в дію Митний кодекс і прийнятий Закон « Про митний тариф». У 1997 році була прийнята нова редакція Закону Республіки Білорусь «Про митний тариф», а 17 липня 1998 року був введений в дію новий Митний кодекс Республіки Білорусь. 2 лютого 2000 року було затверджено нове Положення про Державному митному комітеті Республіки Білорусь.
Одним з останніх документів є нова редакція Митного кодексу Республіки Білорусь, що вступила в силу 1 липня 2007 року. У новому Митному кодексі враховані принципи регулювання зовнішньоторговельних відносин Всесвітньої митної організації та механізми митного регулювання.
У Митному кодексі викладено також основні функції митних органів Республіки Білорусь.
У березні 2001 року по Указом президента Білорусі, «в цілях збереження і розвитку історичних традицій митних органів», були засновані геральдичний знак — емблема і прапор митних органів Республіки.